病毒进化论是近些年出现的一个理论，主要是辩证达尔文的《进化论》所不能解释的问题，达尔文的进化论主张优胜劣汰、适者生存，从而物种在不断地进化着，但是有些物种并不能证明是朝着积极的方向一点一点进化，而更像是突然性的基因突变形成的。根据病毒进化的观点，人类的基因组不仅是一个“自我进化”的过程，还从外部整合了诸如病毒等入侵者的基因，也就是说人类得以进化至此，病毒扮演者极为重要的角色，病毒携带的基因片段整合到人类的固有基因中。 使人类基因不断改变从而实现进化，这个理论否定了达尔文的自然选择学说，并让人们开始重新思考病毒存在的意义，我们到底来自哪里？我们先从达尔文进化论的经典例子长颈鹿来解释，长颈鹿按照进化论的推演是地上和低处的食物渐渐吃完了，为了生存它们开始吃高处的叶子，从而导致脖子越伸越长，但是从历史上看那些类似斑马等低矮动物在这个过程中也活了下来，过去曾经有人以为霍加狓是长颈鹿和斑马交配产生的。 但实际上它与斑马不是近亲，长颈鹿脖子变长之前的模样跟霍加狓差不多，它们也没有让自己的脖子变长，那么物种演变的原因就还有一种可能那就是病毒改造了基因，我们都知道生物最小的单位叫做细胞，但是病毒比细胞还要小，病毒的结构非常简单，一个蛋白质外壳，包含着一个DNA或者RNA的遗传物质，DNA是双螺旋结构，而RNA是一条长链结构，因此RNA病毒很不稳定，经常发生变异，而当RNA病毒进入生物体内并且结合细胞，是由相当大的概率造成基因突变的。 由此我们是否可以联想长颈鹿在生长过程中接触到外部病毒而发生了基因突变，从而造成了整个族群的进化，这里要说达尔文进化论中优胜劣汰可以解释单个个体的进化，而并不能拓展到整个族群带来相同的进化，那么由此是否可以猜想人类是因为接触到了某种原始病毒而基因突变产生了智慧呢？人类目前探寻到的一个例子也可以间接说明这一猜想， 有一种叫做噬菌体的病毒会造成大肠杆菌的进化。 | 
